RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524803.5

SAAL1-202, Transcript of serum amyloid A like 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SAAL1, Length 1,582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAAL1-202ENST00000524803 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.49■■■■■ 5.03
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SAAL1-202ENST00000524803 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.86■■■■□ 3.81
SAAL1-202ENST00000524803 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.61■■■■□ 3.77
SAAL1-202ENST00000524803 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.5■■■■□ 3.75
SAAL1-202ENST00000524803 NACADO15069 1562 aa38.46■■■■□ 3.75
SAAL1-202ENST00000524803 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.45■■■■□ 3.75
SAAL1-202ENST00000524803 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.35■■■■□ 3.73
SAAL1-202ENST00000524803 SCRIBQ14160 1630 aa37.49■■■■□ 3.59
SAAL1-202ENST00000524803 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.42■■■■□ 3.58
SAAL1-202ENST00000524803 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.17■■■■□ 3.54
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SAAL1-202ENST00000524803 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.08■■■■□ 3.53
SAAL1-202ENST00000524803 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.16■■■■□ 3.38
SAAL1-202ENST00000524803 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
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SAAL1-202ENST00000524803 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.84■■■■□ 3.33
SAAL1-202ENST00000524803 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.84■■■■□ 3.33
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SAAL1-202ENST00000524803 SMARCA2P51531 1590 aa35.58■■■■□ 3.29
SAAL1-202ENST00000524803 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.58■■■■□ 3.29
SAAL1-202ENST00000524803 NCAPD3P42695 1498 aa35.51■■■■□ 3.28
SAAL1-202ENST00000524803 WIZO95785 1651 aa35.45■■■■□ 3.27
SAAL1-202ENST00000524803 HMGXB3Q12766 1538 aa35.37■■■■□ 3.25
SAAL1-202ENST00000524803 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
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SAAL1-202ENST00000524803 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.51■■■■□ 3.12
SAAL1-202ENST00000524803 NESP48681 1621 aa34.45■■■■□ 3.11
SAAL1-202ENST00000524803 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.44■■■■□ 3.1
SAAL1-202ENST00000524803 CFTRP13569 1480 aa34.43■■■■□ 3.1
SAAL1-202ENST00000524803 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.22■■■■□ 3.07
SAAL1-202ENST00000524803 PRDM2Q13029 1718 aa34.11■■■■□ 3.05
SAAL1-202ENST00000524803 ERCC6Q03468 1493 aa34.1■■■■□ 3.05
SAAL1-202ENST00000524803 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.1■■■■□ 3.05
SAAL1-202ENST00000524803 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.01■■■■□ 3.03
SAAL1-202ENST00000524803 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.99■■■■□ 3.03
SAAL1-202ENST00000524803 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.83■■■■□ 3.01
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SAAL1-202ENST00000524803 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.62■■■□□ 2.97
SAAL1-202ENST00000524803 TOPBP1Q92547 1522 aa33.61■■■□□ 2.97
SAAL1-202ENST00000524803 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.61■■■□□ 2.97
SAAL1-202ENST00000524803 CUX1P39880 1505 aa33.58■■■□□ 2.97
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SAAL1-202ENST00000524803 SYNJ1O43426 1573 aa33.46■■■□□ 2.95
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SAAL1-202ENST00000524803 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.42■■■□□ 2.94
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SAAL1-202ENST00000524803 IFT140Q96RY7 1462 aa33.27■■■□□ 2.92
SAAL1-202ENST00000524803 SOGA1O94964 1423 aa33.25■■■□□ 2.91
SAAL1-202ENST00000524803 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.22■■■□□ 2.91
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SAAL1-202ENST00000524803 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.21■■■□□ 2.91
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SAAL1-202ENST00000524803 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.1■■■□□ 2.89
SAAL1-202ENST00000524803 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
SAAL1-202ENST00000524803 WDR97A6NE52 1622 aa33.03■■■□□ 2.88
SAAL1-202ENST00000524803 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
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SAAL1-202ENST00000524803 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.88■■■□□ 2.85
SAAL1-202ENST00000524803 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.88■■■□□ 2.85
SAAL1-202ENST00000524803 KIF27Q86VH2 1401 aa32.86■■■□□ 2.85
SAAL1-202ENST00000524803 GRIN2BQ13224 1484 aa32.8■■■□□ 2.84
SAAL1-202ENST00000524803 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.72■■■□□ 2.83
SAAL1-202ENST00000524803 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.7■■■□□ 2.83
SAAL1-202ENST00000524803 PBRM1Q86U86 1689 aa32.7■■■□□ 2.83
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SAAL1-202ENST00000524803 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
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SAAL1-202ENST00000524803 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
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SAAL1-202ENST00000524803 GRIN2AQ12879 1464 aa32.37■■■□□ 2.77
SAAL1-202ENST00000524803 CHD1O14646 1710 aa32.36■■■□□ 2.77
SAAL1-202ENST00000524803 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.34■■■□□ 2.77
SAAL1-202ENST00000524803 OSCARQ8IYS5 282 aa32.27■■■□□ 2.76
SAAL1-202ENST00000524803 NUP160Q12769 1436 aa32.22■■■□□ 2.75
SAAL1-202ENST00000524803 KIF21BO75037 1637 aa32.22■■■□□ 2.75
SAAL1-202ENST00000524803 CEP170Q5SW79 1584 aa32.17■■■□□ 2.74
SAAL1-202ENST00000524803 GOLGA3Q08378 1498 aa32.1■■■□□ 2.73
SAAL1-202ENST00000524803 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.07■■■□□ 2.73
SAAL1-202ENST00000524803 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.05■■■□□ 2.72
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