Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2E1P29083 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2E1P29083 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms