Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
USP20Q9Y2K6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP20Q9Y2K6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP20Q9Y2K6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP20Q9Y2K6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms