Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSX2IPQ9Y2D8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SSX2IPQ9Y2D8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SSX2IPQ9Y2D8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SSX2IPQ9Y2D8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SSX2IPQ9Y2D8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms