Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MAPRE3Q9UPY8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAPRE3Q9UPY8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MAPRE3Q9UPY8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MAPRE3Q9UPY8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms