Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SAMD4AQ9UPU9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SAMD4AQ9UPU9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMD4AQ9UPU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMD4AQ9UPU9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms