Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM35Q9UPQ4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRIM35Q9UPQ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM35Q9UPQ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRIM35Q9UPQ4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM35Q9UPQ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM35Q9UPQ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM35Q9UPQ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms