Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX6Q9UPM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX6Q9UPM6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX6Q9UPM6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX6Q9UPM6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms