Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP18Q9UMW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP18Q9UMW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP18Q9UMW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP18Q9UMW8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP18Q9UMW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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