Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM8Q9UJA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCM8Q9UJA3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCM8Q9UJA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms