Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRRDQ9UH36 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRRDQ9UH36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRRDQ9UH36 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRRDQ9UH36 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRRDQ9UH36 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms