Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPARGC1AQ9UBK2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPARGC1AQ9UBK2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms