Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NCDNQ9UBB6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCDNQ9UBB6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCDNQ9UBB6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCDNQ9UBB6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCDNQ9UBB6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms