Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC17A6Q9P2U8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC17A6Q9P2U8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC17A6Q9P2U8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC17A6Q9P2U8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC17A6Q9P2U8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms