Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL42Q9P2K6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL42Q9P2K6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL42Q9P2K6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL42Q9P2K6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms