Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H3

IFT80, Intraflagellar transport protein 80 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT80Q9P2H3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT80Q9P2H3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT80Q9P2H3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT80Q9P2H3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT80Q9P2H3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT80Q9P2H3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFT80Q9P2H3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT80Q9P2H3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT80Q9P2H3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT80Q9P2H3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms