Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIN1Q9NXP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIN1Q9NXP7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIN1Q9NXP7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIN1Q9NXP7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GIN1Q9NXP7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.1 ms