Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD1Q9NXG2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THUMPD1Q9NXG2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD1Q9NXG2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD1Q9NXG2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
THUMPD1Q9NXG2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms