Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C2orf42Q9NWW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C2orf42Q9NWW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C2orf42Q9NWW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C2orf42Q9NWW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
C2orf42Q9NWW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms