Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOMER3Q9NSC5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HOMER3Q9NSC5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HOMER3Q9NSC5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOMER3Q9NSC5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms