Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRM3Q9NNZ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRM3Q9NNZ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRM3Q9NNZ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRM3Q9NNZ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms