Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P2

NELFA, Negative elongation factor A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFAQ9H3P2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFAQ9H3P2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NELFAQ9H3P2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NELFAQ9H3P2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NELFAQ9H3P2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms