Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1EQ9GZS1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1EQ9GZS1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR1EQ9GZS1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1EQ9GZS1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms