Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLR2J2Q9GZM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR2J2Q9GZM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR2J2Q9GZM3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms