Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL4Q9C0H6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL4Q9C0H6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL4Q9C0H6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL4Q9C0H6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL4Q9C0H6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms