Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCLK3Q9C098 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCLK3Q9C098 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK3Q9C098 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DCLK3Q9C098 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK3Q9C098 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms