Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHCBP1LQ9BZQ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SHCBP1LQ9BZQ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SHCBP1LQ9BZQ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SHCBP1LQ9BZQ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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