Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTPBP4Q9BZE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTPBP4Q9BZE4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GTPBP4Q9BZE4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTPBP4Q9BZE4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms