Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BARHL1Q9BZE3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARHL1Q9BZE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BARHL1Q9BZE3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARHL1Q9BZE3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms