Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC11CQ9BY50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC11CQ9BY50 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC11CQ9BY50 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC11CQ9BY50 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC11CQ9BY50 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms