Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG6Q9BXT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNG6Q9BXT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CACNG6Q9BXT2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CACNG6Q9BXT2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms