Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STRA6Q9BX79 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
STRA6Q9BX79 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
STRA6Q9BX79 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
STRA6Q9BX79 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms