Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RSG1Q9BU20 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RSG1Q9BU20 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSG1Q9BU20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RSG1Q9BU20 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RSG1Q9BU20 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms