Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HERPUD2Q9BSE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HERPUD2Q9BSE4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HERPUD2Q9BSE4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HERPUD2Q9BSE4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERPUD2Q9BSE4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms