Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GAL3ST1Q99999 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAL3ST1Q99999 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GAL3ST1Q99999 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAL3ST1Q99999 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAL3ST1Q99999 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms