Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRRT1Q99946 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT1Q99946 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT1Q99946 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRT1Q99946 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms