Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGREF1Q99674 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGREF1Q99674 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CGREF1Q99674 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CGREF1Q99674 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms