Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDX2Q99626 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDX2Q99626 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDX2Q99626 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDX2Q99626 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDX2Q99626 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDX2Q99626 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDX2Q99626 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDX2Q99626 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDX2Q99626 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDX2Q99626 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDX2Q99626 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDX2Q99626 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDX2Q99626 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDX2Q99626 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDX2Q99626 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDX2Q99626 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDX2Q99626 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDX2Q99626 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDX2Q99626 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDX2Q99626 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDX2Q99626 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CDX2Q99626 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDX2Q99626 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDX2Q99626 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDX2Q99626 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CDX2Q99626 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDX2Q99626 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CDX2Q99626 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CDX2Q99626 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms