Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DERL3Q96Q80 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DERL3Q96Q80 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DERL3Q96Q80 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DERL3Q96Q80 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DERL3Q96Q80 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms