Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CIB3Q96Q77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CIB3Q96Q77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CIB3Q96Q77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIB3Q96Q77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms