Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SYNGAP1Q96PV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYNGAP1Q96PV0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYNGAP1Q96PV0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SYNGAP1Q96PV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYNGAP1Q96PV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms