Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC16BQ96JE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC16BQ96JE7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC16BQ96JE7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms