Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA1

POM121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POM121Q96HA1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POM121Q96HA1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POM121Q96HA1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POM121Q96HA1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POM121Q96HA1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms