Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHMP6Q96FZ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHMP6Q96FZ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP6Q96FZ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP6Q96FZ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms