Protein–RNA interactions for Protein: Q96AX1

VPS33A, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33AQ96AX1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS33AQ96AX1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS33AQ96AX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS33AQ96AX1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS33AQ96AX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS33AQ96AX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms