Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC74AQ96AQ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC74AQ96AQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC74AQ96AQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC74AQ96AQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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