Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NXPE3Q969Y0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NXPE3Q969Y0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NXPE3Q969Y0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NXPE3Q969Y0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NXPE3Q969Y0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NXPE3Q969Y0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms