Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3AQ92664 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GTF3AQ92664 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF3AQ92664 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF3AQ92664 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms