Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT9Q92600 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT9Q92600 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT9Q92600 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT9Q92600 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms