Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOCS4Q8WXH5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOCS4Q8WXH5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOCS4Q8WXH5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SOCS4Q8WXH5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SOCS4Q8WXH5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SOCS4Q8WXH5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SOCS4Q8WXH5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SOCS4Q8WXH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SOCS4Q8WXH5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOCS4Q8WXH5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SOCS4Q8WXH5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms